En 1767, après l’expulsion des jésuites d’Espagne, la basilique fut annexée à la paroisse de San Nicolás puis fut cédée en 1892 aux religieux rédemptoristes. En 1927, après la construction de la nouvelle église de San Ignacio, la nef de l’ancienne basilique fut en partie démolie, laissant à découvert l’endroit où la tradition veut que le saint soit tombé, aujourd’hui signalé par une plaque, alors qu’il se trouvait autrefois à l’intérieur du temple.

Par la rue Cortes de Navarra, nous arrivons à la côte de Labrit, où s’achève la rue de San Agustín. Dans cette rue se trouve la Basilique de San Martín (3), un petit édifice baroque avec un portail créé par Pedro de Aizpún au XVIIIe. Au-dessus du portail, on peut voit un ostensoir, emblème de la Confrérie du Saint Sacrement qui occupe la chapelle, et de chaque côté deux petits écussons avec les Cinq Plaies. Dans la même rue, l’église de San Agustín (4) est située à l’emplacement de l’ancien couvent des Augustins, fondé par Charles II de Navarre en 1355. L’édifice qui est parvenu jusqu’à nous suit le modèle de plan conventuel du XVIe siècle, date à laquelle fut érigée l’église que nous pouvons contempler aujourd’hui. La façade néanmoins fut construite entre 1887 et 1900, suivant les plans de l’architecte diocésain Florencio Ansoleaga. À l’intérieur, nous trouvons quelques retables baroques, parmi lesquels on distingue ceux de Saint Joseph et celui de l’Ange Gardien, tout deux issus du couvent du Carmen Calzado aujourd’hui disparu.

Pendant la virulente épidémie de peste que souffrit la ville en 1599, l’évêque eut une révélation qui lui promettait que les personnes saines ne tomberaient pas malades et que les malades guériraient si on leur posait sur la poitrine un timbre représentant les Cinq Plaies du Christ. 
Vu l’efficacité de la mesure et en signe de reconnaissance, le Régiment de la Ville décida de célébrer perpétuellement ce vœu appelé « des Cinq Plaies ».

   
La rue Compañía, parallèle à la précédente, reçoit ce nom de la première maison de la Compagnie de Jésus à Pampelune, inaugurée au XVIe siècle. Bientôt, les Jésuites fondirent le Collège de la Anunciata et au début du XVIIe siècle, ils édifièrent à côté l’église de Jésus et Marie (5), qui après l’expulsion de l’Ordre, se convertit en chapelle du séminaire, comme on peut lire sur l’inscription de sa façade. En 1927, l’église revint aux mains des jésuites, mais lors de la construction du nouveau collège, on y transféra l’église de Saint Jean Baptiste de la Navarrería en 1951. Actuellement, le bâtiment est occupé par l’École Officielle de Langues de Navarre, qui a ouvert ses portes en 1978 et qui abrite en son intérieur la cour de l’ancien collège.

Ce n’est qu’au XVIe siècle qu’on décida d’y installer les frères dominicains, après qu’on les ait fait déménager de leur ancien emplacement sur la place du Castillo, pour pouvoir élever à cet endroit le château de Ferdinand le Catholique. 

Le couvent primitif se trouvait sous l’invocation de Saint Jacques, car à l’intérieur de ses dépendances se trouvait un ermitage consacré à l’apôtre. C’est pour cette raison qu’on peut encore contempler sur le portail de l’édifice actuel une statue du saint habillé en pèlerin avec deux autres saints dominicains, Saint Thomas d’Aquin et Saint Vincent Ferrer.

L’église de Santiago (Saint Jacques) suit la typologie caractéristique des temples dominicains : une grande nef avec des chapelles communiquant entre elles entre les contreforts, un transept saillant et l’abside pentagonale entre deux chapelles carrées. La façade fut construite a posteriori, dans la seconde moitié du XVIIIe. A l’intérieur on distingue, en plus d’intéressants exemplaires de retables baroques, le grand retable, réalisé par Pierre Picart et Juan de Beauves, la chapelle rococo de San Vicente, située face à la porte d’entrée, le relief de la Sainte Famille, de 1560, qui se trouve dans la chapelle de Notre Dame de Nieva et l’orgue, de la moitié du XVIIIe.

A partir de 1757, on y donna des cours de médecine et d’anatomie. L’hôpital fonctionna comme tel jusqu’en 1925 et à partir de 1956 se convertit en siège du Musée de Navarre. 

En 1932, l’Hôpital de bienfaisance vint à dépendre des Services Sanitaires de Navarre et fut transféré à la zone connue comme "Soto de Barañain", où il fonctionne encore actuellement.

La collection : le musée expose au sous-sol des pièces de la préhistoire et de la protohistoire. Le premier étage est consacré à l’art roman, où on distingue la collection de mosaïques issues principalement de villas rurales. L’art médiéval est réparti sur le premier et le deuxième étage et parmi les pièces exposées on distingue pour leur excellente qualité les chapiteaux romans provenant de l’ancienne cathédrale, le coffret hispano-musulman du monastère de Leire et un calice, cadeau de Charles III à l’église de Sainte Marie de Ujué. Les œuvres de la Renaissance se trouvent au deuxième étage et, outre l’ensemble des peintures murales en provenance du palais d’Oriz, on peut admirer une magnifique statue en bois de Saint Jérôme pénitent, œuvre de Juan de Anchieta. Le troisième étage est consacré aux XVIIe, XVIIIe et XIXe siècles, avec des œuvres de Vicente Berdusán, Claudio Coello et Mateo Cerezo, en plus du cycle de la Création peint sur cuivre par le flamand Jacob Bouttats. Le portrait du Marquis de San Adrián, peint par Goya en 1804, mérite une mention spéciale. La collection s’achève sur des œuvres du XXe siècle.

Couvent des Carmélites Déchausés (10)
Au cours du XVIIe siècle, les nouvelles fondations d’ordres religieux s’établissent peu à peu à l’intérieur de la ville. Les premières furent les Carmélites Déchaussées, qui occupèrent le terrain laissé libre suite à la démolition du château de Ferdinand le Catholique ; elles furent suivies des Soeurs Augustines Récollettes et des Pères Carmélites Déchaussés.

Finalement les autorisations furent obtenues et l’église des pères Carmélites s’acheva en 1673. La façade peut être contemplée avec une certaine perspective, malgré sa situation dans le réseau urbain serré du vieux quartier, car les Pères Carmélites se chargèrent de démolir une partie des édifications voisines pour élargir la rue Descalzos en arrivant au couvent. 

Les plans correspondent à l’architecture conventuelle typique du XVIIe siècle, très similaires à la proche église des Récollettes. À l’intérieur, on distingue la chapelle de Saint Joachim, rénovée au XVIIIe siècle avec une profusion de décorations en plâtre.

A l’intérieur se trouve la Vierge de l’Espérance (ou « de la O »), une sculpture monumentale réalisée en pierre polychromée et datant de la première moitié du XIVe siècle, qu’on compare habituellement à la Vierge de l’Amparo du cloître de la cathédrale de Pampelune. Sur cette sculpture, on remarque tout particulièrement l’attitude de l’Enfant, qui caresse avec sa main le menton de sa mère, comme dans certaines représentations françaises de la Vierge.

L’austérité de l’extérieur de l’édifice ne reflète pas les riches retables baroques qu’abrite l’intérieur du temple. On remarque le retable majeur de l’autel et les deux retables latéraux, qui forment un magnifique ensemble commandé en 1700 à Francisco Gurrea y García. 

Pour la décoration du temple, il existait en outre une collection de tapis basée sur des tableaux de Rubens, qui n’avait d’égale que celle du Monastère des Déchaussées Royales de Madrid.

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